Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ0

Cd300a, CMRF35-like molecule 8, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300aQ6SJQ0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300aQ6SJQ0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300aQ6SJQ0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300aQ6SJQ0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300aQ6SJQ0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300aQ6SJQ0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300aQ6SJQ0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300aQ6SJQ0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300aQ6SJQ0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300aQ6SJQ0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300aQ6SJQ0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300aQ6SJQ0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd300aQ6SJQ0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd300aQ6SJQ0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd300aQ6SJQ0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd300aQ6SJQ0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd300aQ6SJQ0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd300aQ6SJQ0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd300aQ6SJQ0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd300aQ6SJQ0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd300aQ6SJQ0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd300aQ6SJQ0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd300aQ6SJQ0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300aQ6SJQ0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cd300aQ6SJQ0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd300aQ6SJQ0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd300aQ6SJQ0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd300aQ6SJQ0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms