Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nudcd1Q6PIP5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudcd1Q6PIP5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.7 ms