Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip4Q6PHZ8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms