Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Snx13Q6PHS6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx13Q6PHS6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms