Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc82Q6PG04 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc82Q6PG04 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms