Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad54bQ6PFE3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms