Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CtifQ6PEE2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 470.3 ms