Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc36Q6PDM4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc36Q6PDM4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms