Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mfsd13aQ6PDE8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms