Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trak1Q6PD31 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trak1Q6PD31 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trak1Q6PD31 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms