Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp49Q6P9L4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Usp49Q6P9L4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Usp49Q6P9L4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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Usp49Q6P9L4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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Usp49Q6P9L4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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Usp49Q6P9L4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp49Q6P9L4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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Usp49Q6P9L4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
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Usp49Q6P9L4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp49Q6P9L4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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