Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc148Q6P5U8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms