Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rrp12Q6P5B0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms