Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms