Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sik3Q6P4S6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms