Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Slx4Q6P1D7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Slx4Q6P1D7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Slx4Q6P1D7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms