Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZR5

Skiv2l, Superkiller viralicidic activity 2-like (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skiv2lQ6NZR5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Skiv2lQ6NZR5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Skiv2lQ6NZR5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms