Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac4Q6NZM9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hdac4Q6NZM9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms