Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms