Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms