Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms