Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms