Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms