Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt40Q6IFX3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt40Q6IFX3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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