Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arhgap20Q6IFT4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms