Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hecw2Q6I6G8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Hecw2Q6I6G8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Hecw2Q6I6G8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hecw2Q6I6G8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hecw2Q6I6G8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hecw2Q6I6G8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hecw2Q6I6G8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Hecw2Q6I6G8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hecw2Q6I6G8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hecw2Q6I6G8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hecw2Q6I6G8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hecw2Q6I6G8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hecw2Q6I6G8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hecw2Q6I6G8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hecw2Q6I6G8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hecw2Q6I6G8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Hecw2Q6I6G8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hecw2Q6I6G8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms