Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Best3Q6H1V1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Best3Q6H1V1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms