Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV1

Fam196b, Protein FAM196B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam196bQ6GQV1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam196bQ6GQV1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam196bQ6GQV1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms