Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cep170Q6A065 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms