Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms