Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf280dQ68FE8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf280dQ68FE8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms