Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab3ipQ68EF0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms