Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrp4eQ66X19 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nlrp4eQ66X19 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nlrp4eQ66X19 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp4eQ66X19 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp4eQ66X19 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp4eQ66X19 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp4eQ66X19 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp4eQ66X19 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp4eQ66X19 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp4eQ66X19 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp4eQ66X19 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp4eQ66X19 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp4eQ66X19 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp4eQ66X19 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp4eQ66X19 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp4eQ66X19 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nlrp4eQ66X19 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nlrp4eQ66X19 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nlrp4eQ66X19 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nlrp4eQ66X19 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nlrp4eQ66X19 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nlrp4eQ66X19 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nlrp4eQ66X19 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms