Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnna3Q65CL1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms