Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprjQ64455 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprjQ64455 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprjQ64455 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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PtprjQ64455 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprjQ64455 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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PtprjQ64455 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprjQ64455 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprjQ64455 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprjQ64455 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprjQ64455 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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PtprjQ64455 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprjQ64455 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprjQ64455 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprjQ64455 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprjQ64455 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprjQ64455 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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PtprjQ64455 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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PtprjQ64455 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprjQ64455 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprjQ64455 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprjQ64455 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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PtprjQ64455 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprjQ64455 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprjQ64455 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprjQ64455 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprjQ64455 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprjQ64455 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprjQ64455 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprjQ64455 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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