Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vamp1Q62442 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vamp1Q62442 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp1Q62442 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp1Q62442 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp1Q62442 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp1Q62442 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp1Q62442 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp1Q62442 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp1Q62442 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp1Q62442 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp1Q62442 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms