Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms