Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sall3Q62255 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sall3Q62255 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sall3Q62255 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms