Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SnrpaQ62189 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SnrpaQ62189 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms