Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema3bQ62177 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema3bQ62177 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema3bQ62177 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema3bQ62177 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema3bQ62177 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema3bQ62177 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sema3bQ62177 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sema3bQ62177 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sema3bQ62177 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema3bQ62177 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms