Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ctr9Q62018 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctr9Q62018 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctr9Q62018 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms