Protein–RNA interactions for Protein: Q61923

Kcna6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna6Q61923 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kcna6Q61923 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Kcna6Q61923 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms