Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga6Q61739 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Itga6Q61739 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms