Protein–RNA interactions for Protein: Q61450

Gp49a, Mast cell surface glycoprotein Gp49A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp49aQ61450 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp49aQ61450 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gp49aQ61450 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gp49aQ61450 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp49aQ61450 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp49aQ61450 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp49aQ61450 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp49aQ61450 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp49aQ61450 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp49aQ61450 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp49aQ61450 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp49aQ61450 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp49aQ61450 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp49aQ61450 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp49aQ61450 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp49aQ61450 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp49aQ61450 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp49aQ61450 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gp49aQ61450 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms