Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BcanQ61361 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BcanQ61361 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BcanQ61361 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BcanQ61361 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BcanQ61361 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BcanQ61361 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BcanQ61361 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BcanQ61361 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BcanQ61361 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BcanQ61361 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BcanQ61361 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BcanQ61361 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BcanQ61361 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BcanQ61361 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BcanQ61361 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BcanQ61361 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BcanQ61361 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BcanQ61361 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BcanQ61361 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BcanQ61361 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BcanQ61361 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BcanQ61361 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BcanQ61361 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BcanQ61361 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BcanQ61361 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BcanQ61361 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BcanQ61361 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BcanQ61361 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BcanQ61361 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BcanQ61361 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BcanQ61361 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BcanQ61361 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BcanQ61361 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BcanQ61361 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BcanQ61361 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BcanQ61361 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BcanQ61361 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BcanQ61361 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BcanQ61361 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BcanQ61361 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms