Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AcanQ61282 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AcanQ61282 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AcanQ61282 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AcanQ61282 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AcanQ61282 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AcanQ61282 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AcanQ61282 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AcanQ61282 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AcanQ61282 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AcanQ61282 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AcanQ61282 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AcanQ61282 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AcanQ61282 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AcanQ61282 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AcanQ61282 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AcanQ61282 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms