Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf9Q61179 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms