Protein–RNA interactions for Protein: Q61144

Psen2, Presenilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen2Q61144 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psen2Q61144 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psen2Q61144 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psen2Q61144 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psen2Q61144 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psen2Q61144 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psen2Q61144 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psen2Q61144 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psen2Q61144 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psen2Q61144 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psen2Q61144 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Psen2Q61144 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psen2Q61144 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psen2Q61144 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psen2Q61144 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Psen2Q61144 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psen2Q61144 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psen2Q61144 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psen2Q61144 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psen2Q61144 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psen2Q61144 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Psen2Q61144 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psen2Q61144 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psen2Q61144 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Psen2Q61144 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psen2Q61144 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psen2Q61144 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psen2Q61144 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psen2Q61144 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psen2Q61144 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psen2Q61144 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psen2Q61144 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms