Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc6Q61143 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc6Q61143 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc6Q61143 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trpc6Q61143 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc6Q61143 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc6Q61143 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc6Q61143 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc6Q61143 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc6Q61143 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc6Q61143 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc6Q61143 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc6Q61143 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc6Q61143 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms