Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf4bQ61136 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf4bQ61136 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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